Fakülteler

• Kırgız-Çin fakültesi
• Tıp Fakültesi
• İlahiyat fakültesi
• Uluslararası Tıp Fakültesi
• Эл аралык билим берүү программаларынын жогорку мектеби
• Дипломдон кийинки үзгүлтүксүз медициналык билим берүү борбору

Kolejler

• Uluslararası Eğitim Programları Koleji
• Tıp Koleji
• Finans ve Hukuk Koleji
• Uzgen Uluslararası Tıp Fakültesi
• STEM İnovasyon Koleji
• Endüstri ve Pedagoji Koleji
• Айыл чарба колледжи
• Курулуш колледжи

Enstitülar

• Araşan İnsani Enstitüsü
• Öğretmenlik Eğitim
• Institute of Mathematics, Physics, Engineering and Information Technologies
• Экономика, бизнес жана менеджмент институту
• Филология жана маданият аралык коммуникация институту
• Тарых жана юридика институту
• Педагогика, искусство жана журналистика институту
• Табият таануу, дене тарбия, туризм жана агрардык технологиялар институту
• Нанотехнология жана жасалма интеллект институту

Liseler

• "Bilim" lisesi
• Kara-Suu lisesi
• Nookat lisesi
• Zirek İlköğretim Okulu
• №12 Кесиптик лицейи
• «Ыйман» окуу-тарбия комплекси

Departmanlar

• İdari İşler departmanı
• ОшМУнун Бизнес паркы
• Эл аралык байланыштар департаменти
• Академиялык өнүгүү департаменти
• Илимди өнүктүрүү департаменти
• Адам ресурстарын башкаруу жана укуктук камсыздоо департаменти

Merkezler

• Yetenek Akademisi
• R. Abdıkadırov Vakfı
• Маалымат жана коомчулук менен байланыш борбору
• Практика жана карьера борбору
• ОшМУнун квалификацияны жогорулатуу борбору
• «Next Generation Hub» борбору
• «Congress Resort OshSu» борбору
• Табигый ресурстар борбору
• Тоо экосистемаларын коргоо жана жашыл инновациялар Консалтинг Борбору
• Илимий изилдөөлөр жана инновациялар борбору